肿瘤相关巨噬细胞microRNA表达谱及生物信息学分析

基础医学与临床 ›› 2012, Vol. 32 ›› Issue (7): 767-772.

肿瘤相关巨噬细胞microRNA表达谱及生物信息学分析

雷宇,刘彦信,葛晔华,史娟,郑德先

中国医学科学院基础医学研究所

收稿日期:2012-04-12 修回日期:2012-05-24 出版日期:2012-07-05 发布日期:2012-06-20
通讯作者: 雷宇 E-mail:timroyal1999@gmail.com
基金资助:
骨髓间充质干细胞瘤化中STAT3信号通路过度激活的作用机制与规避研究;骨髓间充质干细胞瘤化中STAT3信号通路过度激活的作用机制与规避研究

Profile of microRNA expression in Tumor Associated Macrophage and bioinformatics analysis

Received:2012-04-12 Revised:2012-05-24 Online:2012-07-05 Published:2012-06-20
Contact: 雷宇 E-mail:timroyal1999@gmail.com

摘要/Abstract

摘要： 目的研究肿瘤相关巨噬细胞（TAM）microRNA的表达谱。方法建立小鼠乳腺癌细胞系4T1移植瘤模型，从移植瘤组织中分离TAM，用基因芯片检测microRNA表达谱，实时荧光定量PCR（Real-time PCR）验证芯片结果并进行生物信息学分析，以小鼠腹腔巨噬细胞（PEC）为阴性对照。结果与阴性对照细胞相比，TAM中有59个microRNAs表达量出现显著变化，其中23个microRNAs表达上调，有36个microRNAs表达下调；实时荧光定量PCR对miR-146a、miR-222、miR-31和miR-877的表达进行了验证，其结果与基因芯片检测结果一致；这些microRNAs参与了多个信号通路的调控。结论 microRNA表达谱及生物信息学分析表明microRNA在TAM分化过程的调控中有重要作用。

关键词: microRNA, 肿瘤相关巨噬细胞, 基因芯片, 生物信息学

Abstract: Objective To investigate the profile of microRNA expression in tumor associated macrophage (TAM). Methods An xenograft mouse model was established by using mouse breast cancer cell line 4T1. TAM were isolated from the tumor tissue. The microRNA expression profile was detected by using a microRNA chip assay. The result of chip assay was validated by real-time PCR and analyzed by bioinformatics. The peritoneal macrophage was used as control. Results There were significant changes in 59 microRNAs’ expression in TAM compared with the negative control. Among these microRNAs, 23 microRNAs’ expression was up regulated and 36 microRNAs down regulated. These microRNAs participate in the regulation of various signaling pathways. Conclusion Profile of microRNA expression and bioinformatics analysis suggested microRNA plays an important role in regulation of TAM differentiation.

Key words: microRNA, tumor associated macrophage, chip, bioinformatics

中图分类号:

R392.11

雷宇刘彦信葛晔华史娟郑德先. 肿瘤相关巨噬细胞microRNA表达谱及生物信息学分析[J]. 基础医学与临床, 2012, 32(7): 767-772.

[1]	王波刘思雨罗红. 重组人烯醇酶-α的原核表达及生物信息学分析[J]. 基础医学与临床, 2019, 39(9): 1300-1304.
[2]	邓资翔左中. ABCA1在脂质沉积中的研究进展[J]. 基础医学与临床, 2017, 37(6): 870-873.
[3]	崔铭萱李伟马良坤平凡刘俊涛伍学焱茅江峰王曦聂敏. ABCG5/8基因microRNA结合位点多态性与妊娠期糖脂代谢相关[J]. 基础医学与临床, 2017, 37(5): 682-686.
[4]	谢丽华孙圣华卢俊娟林桦. COPD动态miRNA表达谱的构建及生物信息学分析[J]. 基础医学与临床, 2016, 36(6): 739-746.
[5]	崔洁洁龚梦嘉何昀毕杨. 全反式维甲酸对小鼠肝癌细胞Hepa1-6增殖、迁移、侵袭的影响及其机制[J]. 基础医学与临床, 2016, 36(2): 211-217.
[6]	钱建升李宇窦建卫. miR-26a对人肝癌细胞系SMMC-7721增殖和迁移的影响[J]. 基础医学与临床, 2016, 36(10): 1335-1340.
[7]	乔子君马文丽郑文岭. 肥胖患者性别差异的基因表达谱数据分析[J]. 基础医学与临床, 2015, 35(6): 723-728.
[8]	李中辉郑文岭马文丽. 2型糖尿病相关基因的生物信息学分析[J]. 基础医学与临床, 2015, 35(6): 749-753.
[9]	魏冲姜志超王昊天张薇李天骄汪玄周道斌. 来那度胺可抑制单核细胞向M2型巨噬细胞分化及相关细胞因子的分泌[J]. 基础医学与临床, 2015, 35(6): 786-791.
[10]	葛超卓刘星霞任少达赵春华. MEF来源的间充质干细胞诱导生成的调节型树突状细胞的基因表达谱分析[J]. 基础医学与临床, 2014, 34(4): 433-438.
[11]	刘凤霞牛淑亮李建勇郑树涛卢晓梅刘文亚. ERK1/2 MAPK 通路在Eca109细胞体外增殖和迁移中的作用及其机制[J]. 基础医学与临床, 2014, 34(3): 345-349.
[12]	柯星张淑平吴梦黄蕾孙瑞红黄珮珺潘世扬王芳. 肿瘤相关M2型巨噬细胞通过Toll样受体增强卵巢癌细胞MMP-9的表达[J]. 基础医学与临床, 2014, 34(10): 1315-1320.
[13]	庞希宁李彩虹施萍王竟刘晓玉张涛张殿宝赵峰. EGF对hAMSCs基因表达谱影响及生物信息学分析[J]. 基础医学与临床, 2013, 33(11): 1391-1397.
[14]	吴燕张莉萍曹炬黄世峰文阳安. HCV核心蛋白对HepG2 细胞microRNA表达谱的影响[J]. 基础医学与临床, 2012, 32(6): 618-622.
[15]	黄春洪. 蛇血清sPLA2抑制剂对人炎症的保护：基于结构与功能的研究 [J]. 基础医学与临床, 2011, 31(9): 970-975.