基础医学与临床 ›› 2014, Vol. 34 ›› Issue (6): 819-823.

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自然反义转录物Lmo4as对神经系统重要编码基因Lmo4的调节功能

张靖1,吴朝1,朱丽媛2,阴彬1,侯琳1,彭小忠3   

  1. 1. 中国医学科学院基础医学研究所
    2. 中国医学科学院基础医学研究所 北京协和医学院基础学院
    3. 中国医学科学院基础医学研究所&北京协和医学院 基础学院 生物化学与分子生物学
  • 收稿日期:2014-03-27 修回日期:2014-04-15 出版日期:2014-06-05 发布日期:2014-05-26
  • 通讯作者: 彭小忠 E-mail:peng_xiaozhong@163.com
  • 基金资助:
    IRES在翻译水平上介导的ADAR1表达上调影响神经胶质瘤发生发展的机制

The natural antisense transcript, Lmo4as, negatively regulated the same locus cortical coding gene Lmo4

  • Received:2014-03-27 Revised:2014-04-15 Online:2014-06-05 Published:2014-05-26
  • Contact: Xiao-zhong PENG E-mail:peng_xiaozhong@163.com

摘要: 目的 探索小鼠神经系统重要编码基因Lmo4基因座位上自然反义转录产物Lmo4as对该编码基因的表达调控功能。方法 1)使用cDNA末端快速扩增(Rapid Amplification of cDNA Ends,RACE)与RT-PCR技术,验证Lmo4as是否具有多聚腺苷酸(polyA)尾,克隆Lmo4as的全长序列; 2)使用实时定量PCR和原位杂交技术确定了Lmo4as及相应编码基因的时空表达谱; 3)使用荧光素酶报告基因实验在体外验证Lmo4as对Lmo4是否具有调控作用。结果1)Lmo4as是一个具有多聚腺苷酸(polyA)尾的非编码RNA转录本,获得其RNA全长信息; 2)Lmo4as与相应编码基因转录本Lmo4的丰度在时间上具有协同性,而在空间表达上具有明显不同的分布; 3)Lmo4as对Lmo4在转录后水平具有负性调节作用,另外miR-124也能够抑制Lmo4的表达。结论 提示编码基因Lmo4基因座位上自然反义转录产物Lmo4as对其转录后水平的负性调节与microRNA的调节共同发挥作用。

关键词: 小鼠大脑发育, Lmo4, 自然反义转录物, 原位杂交, 转录后调控

Abstract: Objective Investigation of the cis regulatory functional role of natural antisense transcript (NAT) in expression of same genome locus coding gene, Lmo4. Methods Rapid Amplification of cDNA Ends (RACE), RT-PCR, real time qRT-PCR, in situ and Luciferase reporter assay were employed to capture the full length of the NAT, to display the spatio-temporal patterns of coding gene and noncoding RNA in the development of embryonic brain, and to analyze the regulatory role of NAT in the expression of Lmo4, respectively. Results The results show that Lmo4as is a noncoding RNA transcript with a poly-A tail, and the full length sequence of this NAT transcript were cloned. Moreover, it was shown that Lmo4as function as a negative regulator on the expression of Lmo4 at the post-transcriptional level, similar with a microRNA functional role, miR-124. Conclusion The NAT Lmo4as function as a cis repressor on the coding gene Lmo4 at post-transcriptional level.

Key words: mouse brain development, Lmo4, natural antisense transcript, in situ, post-transcriptional regulation

中图分类号: